Lizoxom cấp 1 là những lizoxom nguyên phát.Là khối cầu nhỏ chứa các emzim thủy phân như hydrolase-acid nhưng chưa tham gia vào quá trình tiêu hóa nội bào.Những lizoxom này chỉ hoạt đi khi môi trường xung quanh có ph<7
Các lizoxom cấp 2 có chứa các enzim hidrolase và chứa cả các chất chưa bị tiêu hóa hoặc đang bị tiêu hóa ( do các lizoxom này đang trong quá trình hoạt động,tiêu hóa nội bào)