Bệnh do động vật nguyên sinh gây ra được nhắc đến nhiều nhất có lẽ là bệnh sốt rét, gây ra bởi trùng sốt rét (Plasmodium). Ngoài ra các bệnh phổ biến khác còn có bệnh tiêu chảy do Amip (Entamoeba) và do Cryptosporidium, thường xảy ra khi ta uống phải nguồn nước bẩn có chứa những sinh vật. Bệnh Chagas và bệnh ngủ châu Phi gây ra bởi loài Trypanosome cũng là những căn bệnh đáng quan tâm nhưng 2 bệnh này không lưu hành ở Việt Nam nên em đừng lo nhé.
Động vật nguyên sinh gây bệnh thường nằm trong nguồn nước bẩn hoặc được truyền qua trung gian bởi muỗi hay là bọ xít. Do đó để tránh bệnh thì nhớ không được uống nước không rõ nguồn gốc, và dọn dẹp nhà cửa sạch sẽ để không còn chỗ trú ẩn cho những con côn trùng này.
Động vật nguyên sinh ảnh hưởng tới sức khỏe con người là:
- Trùng sốt rét: gây bệnh sốt rét ở người
- Trùng kiết lị: gây bệnh kiết lị
